La Copa Aerosur de 2006 fue la 4ª versión del torneo amistoso de carácter anual que organizaba esta línea aérea boliviana. Se jugó en tres ciudades, La Paz, Cochabamba y Santa Cruz de la Sierra con la participación de 6 de los equipos denominados "grandes" de la Liga Boliviana.
Equipos participantes
Primera Fase
En esta fase los clásicos rivales de cada ciudad juegan dos partidos (ida y vuelta) entre sí y clasifican a las semifinales los tres ganadores y el mejor perdedor . En caso de empate en puntos no se toma en cuenta la diferencia de gol, sino que se define por penales al vencedor de la llave.
Santa Cruz
La Paz
Cochabamba
Semifinales
Semifinal 1
Semifinal 2
(*) Blooming ganó 3-1 en la definición por penales
Finales
Final
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