Born in Basel,[1] Staehelin first studied ancient languages, history, school music and flute. In 1967, he received his doctorate in musicology and ancient languages as minor subjects.
After his Zurich habilitation on the composer Heinrich Isaac, Staehelin first became director of the Beethoven Archive and Beethoven House in Bonn before being appointed professor of musicology at the University of Göttingen in 1983.
Die mittelalterliche Musik-Handschrift W1: Vollständige Reproduktion des ‘Notre Dame’-Manuskripts der Herzog August Bibliothek Wolfenbüttel Cod. Guelf. 628 Helmst.[3] Wolfenbütteler Mittelalter-Studien 9. Harrassowitz, Wiesbaden 1995, ISBN3-447-03779-2.
Ein unbekannter Brief von Ulrich von Wilamowitz-Moellendorff an Felix Staehelin über die 'Geschichte der kleinasiatischen Galater'. In: Klio. volume 76 (1994), pp. 454–467
Musikwissenschaft und Musikpflege an der Georg-August-Universität Göttingen: Beiträge zu ihrer Geschichte. Göttingen: Vandenhoeck & Ruprecht, 1987. ISBN3-525-35832-6. 200 pages.
"Pierre de La Rue," in The New Grove Dictionary of Music and Musicians, ed. Stanley Sadie. 20 vol. London, Macmillan Publishers Ltd., 1980. ISBN1-56159-174-2
Die Messen Heinrich Isaacs: Quellenstudien zu Heinrich Isaac und seinem Messen-Oeuvre. 3 vols, Publikationen der Schweizerischen Musikforschenden Gesellschaft. Bern - Stuttgart: Haupt, 1977.