Keller besuchte die Kunstgewerbeschule Zürich und bildete sich in der
Psychiatrischen Universitätsklinik Burghölzli zum Psychiatriepfleger aus. 1974 absolvierte er einen Studienaufenthalt im staatlichen Künstleratelier Amsterdam. 1975/76 studierte er Druckgrafik an der Kunstgewerbeschule Zürich. Seit 1972 arbeitet Willi Keller als freischaffender Künstler – bis 1982 in Zürich und seither in Marbach SG. 2000 fügte er einen Studienaufenthalt in der Cité internationale des arts in Paris an. 2001 erhielt er den Anerkennungspreis der Arbeitsgemeinschaft Rheintal-Werdenberg. Keller ist seit 1972 Mitglied des Berufsverbandes Visarte.
Eingeschlossen - Alltag und Aufbruch in der psychiatrischen Klinik Burghölzli zur Zeit der Brandkatastrophe von 1971 von Sabine Jenzer, Willi Keller, Thomas Meier, Chronos Verlag Zürich, 2017, ISBN 978-3-0340-1414-4
Werkkatalog I, 1969–1977 mit einer Einleitung von Peter Killer, Galerie Kolin, Zug
Werkkatalog II, 1977–1980 mit einer Einleitung von Peter Killer, Galerie Kolin, Zug