Theodor von Jürgensen studierte Medizin in Kiel, Breslau und Tübingen, wo er 1863 promoviert wurde. Er lehrte in Kiel ab 1864 als Privatdozent und ab 1869 als außerordentlicher Professor und Leiter der Poliklinik und wurde 1873 ordentlicher Professor als Direktor der Poliklinik in Tübingen.
Er befasste sich mit Kardiologie, Lungenerkrankungen (Pneumonie) und Infektionskrankheiten wie Masern.
Klinische Studien über die Behandlung des Abdominaltyphus mittels des kalten Wassers. F. C. W. Vogel, Leipzig 1866 Google Books
Die Körperwärme des gesunden Menschen. F. C. W. Vogel, Leipzig 1873 Google Books
Kruppöse Pneumonie, Katarrhalpneumonie, in Hugo Wilhelm von Ziemssen's „Handbuch der speciellen Pathologie und Therapie“ 1874
Artikel Antiphlogistische Heilmethoden, Blutentziehungen Transfusion, in Ziemssen's „Handbuch der allgemeinen Therapie“, 1880
Kruppöse Pneumonie: Beobachtungen aus der Tübinger Poliklinik, 1883
Mitteilungen aus der Tübinger Poliklinik, 1886, 1892
Lehrbuch der speciellen Pathologie und Therapie. 3. Auflage, Veit & Comp., Leipzig 1894 Archive
Acute Exantheme: Allgemeines, Masern, Scharlach, Rötheln, Varicellen, 1894 bis 1896
Erkrankungen der Kreislaufsorgane, Insufficienz, Schwäche, des Herzens, in: Petzold, Stintzing, Handbuch der speziellen Therapie, 1899
Behandlung der Erkrankungen der Athmungsorgane: Prophylaxe und allgemeine Behandlung, Behandlung der Luftröhrenerkrankungen, der Lungenkrankheiten (ausschl. Lungentuberculose), 1895
