Titelverteidiger im Einzel war der Schweizer Roger Federer, der bereits im Achtelfinale an Kei Nishikori scheiterte. Das Finale bestritten der Lokalmatador Rafael Nadal und der Schweizer Stanislas Wawrinka, wobei der Spanier deutlich in zwei Sätzen mit 6:2 und 6:4 gewann. Für Nadal war es im siebten Finale im laufenden Jahr bereits sein fünfter Titel. Durch diesen Sieg zog er mit Roger Federer gleich, was die Turniersiege in Madrid betreffen. Beide konnten das Turnier je dreimal gewinnen. Im Doppel war das polnische Duo Mariusz Fyrstenberg und Marcin Matkowski die Titelverteidiger, sie schieden jedoch bereits im Achtelfinale aus. Sieger der diesjährigen Austragung wurde das US-amerikanische Brüderpaar Bob und Mike Bryan. Sie gewannen das Finale gegen Alexander Peya und Bruno Soares in zwei Sätzen und feierten damit bereits ihren fünften Turniersieg in diesem Jahr.
Das Teilnehmerfeld der Einzelkonkurrenz bestand aus 56 Spielern, jenes der Doppelkonkurrenz aus 24 Paaren. Die acht topgesetzten Spieler im Einzel bzw. Paarungen im Doppel erhielten jeweils ein Freilos in die zweite Runde.
Die Qualifikation für die Mutua Madrid Open 2013 fand am 4. und 5. Mai 2013 statt. Aus 28 Teilnehmern wurden sieben Qualifikantenplätze ausgespielt, die zur Teilnahme am Hauptfeld des Turniers berechtigten.
Bei den Mutua Madrid Open 2013 wurden die folgenden Preisgelder und Weltranglistenpunkte für das Erreichen der jeweiligen Runde ausgezahlt bzw. gutgeschrieben. Spieler, die aus der Qualifikation in das Hauptfeld eintraten, erhielten die angegebenen Qualifikationspunkte zusätzlich zu denen für das Erreichen der jeweiligen Runde. Ansonsten sind die Beträge nicht kumulativ zu verstehen. Die Beträge für den Doppelbewerb galten je Spieler.