Nach der Schulzeit besuchte Pfister den einjährigen Vorkurs an der Kunstgewerbeschule in Bern. 1977–1981 absolvierte er seine Grafikerausbildung in der Werbeagentur Amrein-Pieren in Herrenschwanden und bildete sich daneben an der Kunstgewerbeschule in Illustrations- und Design-Kursen weiter. 1981–1983 arbeitete er in der Werbeagentur Alexandre Ott in Zürich, bevor er dann für 6 Monate die Vereinigten Staaten, Kanada und Mexiko bereiste. Nach der Rückkehr in die Schweiz machte Pfister sich als Grafikdesigner und Konzepter selbständig, arbeitete aber auch als Künstler im Bereich Skulptur und Fotografie. 1984/85 entstand sein erstes Bilderbuch „Die müde Eule“ das 1986 vom NordSüd Verlag veröffentlicht wurde, wodurch eine jahrzehntelange, erfolgreiche Zusammenarbeit mit diesem Verlag entstand. Der internationale Durchbruch gelang Pfister 1992 mit seinen Buch Der Regenbogenfisch. Es handelt von einem Fisch, der seine glitzernden Schuppen nicht mit den anderen Fischen teilen will. Es folgten mehrere Regenbogenfisch-Bücher, die sehr erfolgreich waren. Auch mit anderen Tierfiguren wie Pinguin Pit sowie den weich verlaufenden Hintergründen seiner Aquarell-Landschaften machte sich Pfister einen Namen.[2] Bis heute hat Marcus Pfister 47 Bücher veröffentlicht, die in 50 Sprachen und Dialekte übersetzt und in einer Gesamtauflage von über 30 Millionen Exemplaren veröffentlicht wurden. Als Illustrator hat Pfister sich nie auf einen bestimmten Stil festgelegt, sondern setzt immer wieder neue Techniken und Bildsprachen ein.[3]
Der amerikanische Fernsehsender PBS produzierte 2000 die 26-teilige Zeichentrickserie Der Regenbogenfisch auf Basis von Pfisters Büchern.[4]
Marcus Pfister hat vier Kinder und lebt mit seiner Frau Debora in Bern. Seine Lesereisen haben ihn schon in die USA, nach Südkorea, Japan und in viele europäische Länder geführt.[5]
↑The Teacher's Calendar: The Day-By-Day Directory to Holidays, Historical Events, Birthdays and Special Days, Weeks and Months. 864.Com, 2003, ISBN 978-0-07-141231-5, S. 246.