Lodwar liegt auf etwa 500 Metern Meereshöhe und ungefähr 360 Kilometer nördlich von Eldoret sowie 120 Kilometer südlich von Kakuma an der von Mombasa über Nairobi, Nakuru, Eldoret und Kitale verlaufenden Straße nach Juba.
In der Region ist es das ganze Jahr über heiß und trocken. Die durchschnittlichen Tageshöchstwerte liegen bei 32 °C bis 35 °C, nachts wird es mit Monatsmittel nicht kälter als 23 °C.
Monatliche Durchschnittstemperaturen und -niederschläge für Lodwar