Lenarviricota

Lenarviricota

Phylum Lenarviricota: TEM-Aufnahmen von Virionen des Ourmia melon virus (OuMV, links) und Bakteriophagen Qβ an einem Pilus von E. coli (unten); Narna- und Mitoviren haben kein Kapsid oder gar Virushülle (rechts)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[2]
Reich: Orthornavirae[1]
Phylum: Lenarviricota
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA
Wissenschaftlicher Name
Lenarviricota
Links
ICTV Taxon History: 202003916
NCBI Taxonomy: 186767
ViralZone (Expasy, SIB): 303

Lenarviricota ist ein Phylum von RNA-Viren, das alle Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität umfasst, die Prokaryoten infizieren; einige Mitglieder infizieren aber auch Eukaryoten.[3]

Der Name des Phylums ist eine Zusammenziehung aus den Namen der Gründungsmitgliederfamilien Leviviridae (jetzt Fiersviridae bw. Klasse Leviviricetes) und Narnaviridae, zusammen mit dem Suffix -viricota, das ein Virenphylum bezeichnet.[4]

Es wird vermutet, dass der Ursprung der Lenarviricota bereits vor dem des letzten universellen gemeinsamen Vorfahren (LUCA) aller zellulären Organismen liegen könnte.[5]

Systematik

Kapsidaufbau des Bakteriophagen MS2 (Spezies Emesvirus zinderi, Familie Fiersviridae)
Phylogenetischer Baum der Lenarviricota (oben), Genom­karte ver­schie­dener Mit­glieder mit den wichtigsten konservierten Proteinen (unten)

Die vom ICTV bestätigte Taxonomie der Lenarviricota ist mit Stand 18. Juni 2021 wie folgt:[6][1]

Phylum Lenarviricota

  • Klasse Amabiliviricetes mit einziger
  • Klasse Howeltoviricetes mit einziger
    • Ordnung Cryppavirales, darin einzige
  • Gattung Mahrahovirus
  • Gattung Nicedsevirus
  • Gattung Nordovirus
  • Gattung Skrubnovirus
  • Gattung „Hohglivirus“ mit einziger Spezies „Hohglivirus simiicola“ (ssRNA-Phage AVE007) ist nicht mehr offiziell anerkannt
  • Gattung „Meihzavirus“ mit einziger Spezies „Meihzavirus luticola“ (ssRNA-Phage SRR7976325_6),
  • Gattung „Sculuvirus“ mit einziger Spezies „Sculuvirus humenecus“ (ssRNA-Phage Zoerhiza.1_24),
  • Gattung „Tetipavirus“ mit einziger Spezies „Tetipavirus asiadaptatum“ (ssRNA-Phage SRR6960799_31),
  • Gattung „Winunavirus“ mit einziger Spezies „Winunavirus asiadaptatum“ (ssRNA-Phage SRR7976310_9) alle ebenso.
  • Klasse Miaviricetes mit einziger

Das NCBI listet darüber hinaus mehr als 860 weitere bisher noch nicht weiter zugeordnete Vorschläge/Kandidaten als Mitgliedsspezies der Lenarviricota auf (Stand 18. Juni 2021).[7]

Phylogenie

Molekulargenetische Analysen haben die folgenden phylogenetischen Beziehungen zwischen den Familien ergeben:[8][9]

 Lenarviricota 
 Norzivirales 

Atkinsviridae


   

Solspiviridae


   

Fiersviridae (früher Leviviridae)


   

Duinviridae





   
 Timlovirales 

Blumeviridae


   

Steitzviridae



   

Howeltoviricetes > Mitoviridae


   

Miaviricetes > Botourmiaviridae


   

Amabiliviricetes > Narnaviridae






Vorlage:Klade/Wartung/Style

Anmerkung: Im Gegensatz zur ICTV-Taxonomie clustern hier die Timlovirales mit den Botourmiaviridae/Mitoviridae/Narnaviridae und nicht mit den Norzivirales, so dass die Leviviricetes (Norzivirales/Timlovirales/…) nicht als Klade (monophyletische Gruppe) erscheinen.

Einzelnachweise

  1. ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  2. ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019.
  3. ↑ Yuri I. Wolf, Darius Kazlauskas, Jaime Iranzo, Adriana Lucía-Sanz, Jens H. Kuhn, Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin: Origins and Evolution of the Global RNA Virome. In: mBio. 9. Jahrgang, Nr. 6, 21. Dezember 2018, ISSN 2150-7511, doi:10.1128/mBio.02329-18, PMID 30482837 (englisch, mbio.asm.org (Memento des Originals vom 14. August 2020 im Internet Archive) [abgerufen am 7. Juli 2020]).  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/mbio.asm.org
  4. ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic, Arvind Varsani, Yuri I. Wolf, Natalya Yutin, M. Zerbini, J. H. Kuhn: Proposal: Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for realm Riboviria. In: International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). (englisch).
  5. ↑ Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin: The LUCA and its complex virome. In: Nature Reviews Microbiology. 14. Juli 2020, doi:10.1038/s41579-020-0408-x, PMID 32665595 (englisch).
  6. ↑ Virus Taxonomy: 2020 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), März 2021, abgerufen am 16. Mai 2021 (englisch).
  7. ↑ NCBI unclassified Lenarviricota (list)
  8. ↑ Yuri I. Wolf, Sukrit Silas, Yongjie Wang, Shuang Wu, Michael Bocek, Darius Kazlauskas, Mart Krupovic, Andrew Fire, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin: Doubling of the known set of RNA viruses by metagenomic analysis of an aquatic virome. In: Nature, Band 5, S. 1262–1270, 20. Juli 2020, doi:10.1038/s41564-020-0755-4
  9. ↑ Dann Turner, Andrew M. Kropinski. Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses, Band 13, Nr. 506, 18. März 2021, doi:10.3390/v13030506