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Der Kaidu entspringt im Tian Shan. Er fließt anfangs in westlicher Richtung in das Yulduz-Becken. Dort wendet er sich nach Süden und schließlich nach Osten und erreicht das Yanqi-Becken. Nach Durchfließen des Verwaltungszentrums des Autonomen Kreises Yanqi bildet der Kaidu ein Flussdelta und mündet in den Bosten-See. Der Kaidu hat eine Länge von 497 km und entwässert ein Areal von 31.750 km².
