Am 19. Januar 1949 starb er im Alter von 88 Jahren in Erfurt. Seine „Geschichte der Stadt Erfurt“ blieb unvollendet.
Schriften
Alfred Kirchhoff. In: Mitteldeutsche Lebensbilder. 1. Band: Lebensbilder des 19. Jahrhunderts. Magdeburg 1926, S. 357–375.
Richard Bärwinkel. In: Historische Kommission für die Provinz Sachsen und für Anhalt (Hrsg.): Mitteldeutsche Lebensbilder. 3. Band Lebensbilder des 18. und 19. Jahrhunderts. Selbstverlag, Magdeburg 1928, S. 507–521.
Wielands Briefwechsel mit der Familie von Keller in Stedten bei Erfurt. Erfurt 1932.
Erfurter Burgenwelt: Die „Wallburg im Steiger“ und das „Schloss Stedten“. Weimar-Buttstädt 1932.
Der Geheime Kommerzienrat Friedrich Ernst (Fritz) Wolff (1839–1928) und sein Geschlecht. Weimar 1933.
Die Einheit Thüringens. Erfurt 1933.
Die Universität Erfurt. Erfurt 1933.
Die Burg Gleichen und ihre Bewohner in Geschichte und Sage. Erfurt 1935.
Heimat und Bildung. Erfurt 1935.
Geschichte der Stadt Erfurt. Band 1. Erfurt 1935.
Erfurt in seinen berühmten Persönlichkeiten. Erfurt 1937.
Auszeichnungen
Ehrendoktorwürde der theologischen Fakultät der Universität Halle 1927
Steffen Raßloff: Flucht in die nationale Volksgemeinschaft. Das Erfurter Bürgertum zwischen Kaiserreich und NS-Diktatur. Köln/Weimar/Wien (Böhlau Verlag) 2003.
Rudolf Benl: Johannes Biereye (1860–1949). Ein Lebensbild. In: Mitteilungen des Vereins für Geschichte und Altertumskunde von Erfurt 60 (1999), S. 121–164
Ernst Lehmann (Hrsg.): Festschrift für Johannes Biereye zum 70. Geburtstag zum 10. Juni 1930. Verlag des Geschichtsvereins, Erfurt 1930