Seit den frühen siebziger Jahren arbeitet Neuenschwander mit Video und Film. 1978 war er Gründungsmitglied der Genossenschaft Container TV, heute Container TV, AG für Film- und Fernsehproduktion. 1979 bis 1981 entwickelte und leitete er ein umfangreiches Community TV Projekt im Berner Tscharnergut Quartier. Seit 1984 ist Neuenschwander Autor zahlreicher Kino-, Fernseh- und Kurzfilme in Bangladesh, Nepal, Mali, Burkina Faso, Bolivien, China (Tibet), den USA und der Schweiz. Weiter war er 1999 bis 2008 tätig bei der Gründung und dem Aufbau des MediaLab, Hochschule der Künste Bern. Ab 1985 übernahm er Lehraufträge u. a. am MAZ – der Schweizer Journalistenschule, an der Schule für Gestaltung Bern und an der Akademie der Bildenden Künste München. Neben der Hochschule der Künste Bern (1999–2016), lehrte Neuenschwander seit 2009 auch als Gast-Professor am College of Design and Innovation, der Tongji-Universität Shanghai (2009–2016).
1987 bis 1995 war er Mitglied der Filmkommission des Kantons Bern und 2005 bis 2008 Mitglied des Fachausschusses „non-fiction“ der Zürcher Filmstiftung.
Anfangs 2016 ist Neuenschwander im Rahmen des Shanghaier „Recruitment Program of Global Experts“ (上海千人计划) als „Overseas High-Livel Talent“ National Chair Professor ans College for Arts & Media 艺术于传媒学院 an die Tongji-Universität in Shanghai berufen worden. Jürg Neuenschwander ist Inhaber und CEO der Firma Container TV, AG für Film- und Fernsehproduktion.