Der Verein wurde 2006 als Department of Science Service FC gegründet.[1] 2009 wurde der Klub in Kanjanapat FC umbenannt. 2018 bis 2019 spielte der Verein in der Thailand Amateur League. 2019 stieg man in die vierte Liga, die Thai League 4, auf. Hier startete man in der Western Region. Nachdem die vierte Liga im März 2020 aufgrund der COVID-19-Pandemie abgebrochen wurde, und der thailändische Verband die Thai League 4 und die Thai League 3 während der Pause zusammenlegte, startete der Verein bei Wiederaufnahme des Spielbetriebes im Oktober 2020 in der Thai League 3. Hier trat man in der Western Region an. Im Sommer 2023 wurde er Verein in Hua Hin Maraleina Football Club umbenannt.
Seine Heimspiele trug der Verein bis 2023 im Valaya Alongkorn Rajabhat University Stadium (thailändischสนามกีฬามหาวิทยาลัยราชภัฏวไลยอลงกรณ์) im Norden der Provinz Pathum Thani aus. Das Stadion hat ein Fassungsvermögen von 2000 Personen.