Der gebürtige Salzburger spielte in der Jugend bei UHC Salzburg.[1] 2003 startete er seine aktive Profi-Karriere beim Rekordmeister A1 Bregenz, dort blieb er bis zu seinem Wechsel 2007 zum ULZ Schwaz.[2][3] Seit der Kooperation zwischen dem ULZ Schwaz und HIT Innsbruck ist er für die HLA-Mannschaft von Handball Tirol aktiv. Nach der Saison 2014/15 beendete Aigner seine Karriere als Spieler und wechselte als Torwarttrainer in den Betreuerstab des Vereins.[4]
Aigner war bereits mehrmals für die österreichische Handballnationalmannschaft im Einsatz, sein Debüt feierte er am 20. Dezember 2011 gegen Algerien.[5]
