Cesare Monti war der jüngere von zwei Söhnen des mailändischen Patriziers und Senators Princivalle Monti und dessen zweiter Frau Anna Landriani. Sein älterer Bruder Marcantonio wurde 1628 ebenfalls Senator.
Drei Jahre später, im Dezember 1632, wurde Monti Erzbischof von Mailand und geriet sofort in einen Konflikt um die Vermögensverwaltung des Erzbistums, der erst 1634 durch Kardinal Federico Borromeo gelöst wurde. Am 1. Juli 1634 empfing Monti den Kardinalshut und am 6. August 1634 wurde er zum Kardinalpriester mit der TitelkircheSanta Maria in Traspontina ernannt.
Politische Probleme rund um den Französisch-Spanischen Krieg machten dem Mailänder Erzbischof schwer zu schaffen. Er übergab die Regelungen der Beziehungen zwischen lombardischen Katholiken und Protestanten schließlich an die Schweizer Kantone. Cesare Monti gehörte zu den Teilnehmern des Konklaves von 1644, aus dem Giovanni Battista Pamphilj als Papst Innozenz X. hervorging.
Cesare Monti starb am 16. August 1650. Sein Grab befindet sich im Mailänder Dom.