Die Categoría Primera B 2006, nach einem Sponsor offiziell Copa Premier 2006 genannt, war die siebzehnte Spielzeit der zweiten kolumbianischen Spielklasse im Fußball der Herren, die aus Apertura und Finalización bestand. Vorjahresmeister war Cúcuta Deportivo. Absteiger aus der ersten Liga war Unión Magdalena.
Meister wurde La Equidad, das damit in die erste Liga aufsteigen konnte. Der Vizemeister Valledupar FC verlor in der Relegation gegen Atlético Huila.
In Apertura und Finalización wurden zunächst alle Mannschaften in zwei Gruppen mit je neun Mannschaften gelost. In jeder Gruppe spielten alle Mannschaften im Ligamodus zweimal gegeneinander, zusätzlich spielte jede Mannschaft gegen ein Team aus der anderen Gruppe. In jeder Gruppe qualifizierten sich die ersten zwei Mannschaften für die Finalrunde, die aus einer Gruppe mit vier Mannschaften bestand. Der Gruppensieger wurde Halbserienmeister.
Die beiden Halbserienmeister sollten sich für das Finale qualifizieren, in dem der Meister und direkte Aufsteiger ermittelt werden sollten. Da La Equidad aber beide Halbserien gewann, wurde das Finale nicht ausgetragen. Stattdessen spielten die Zweiten der beiden Halbserien den Vizemeister aus. Der Vizemeister spielte eine Relegation gegen den Vorletzten der ersten Liga. Absteiger aus der zweiten Liga gab es nicht.
Teilnehmer
Die folgenden Vereine nahmen an den beiden Halbserien der Spielzeit 2006, Apertura und Finalización, teil. Córdoba FC übernahm das Startrecht von Florida Soccer. Expreso Rojo zog von Sincelejo nach Cartagena um. Bello FC wurde in Atlético Bello umbenannt. Dépor zog von Cartago nach Jamundí um. Bogotá FC spielte aufgrund von Umbaumaßnahmen am Stadion in Soacha die erste Halbserie in Sibaté und kehrte dann wieder nach Soacha zurück.
Nach der Apertura konnte La Equidad auch die Finalización gewinnen. Deswegen war kein Finale nötig. La Equidad war der Meister der Categoría Primera B 2006 und stieg in die erste Liga auf.
Spiel um Platz 2
Die beiden Zweiten der Halbserien, Valledupar FC und Cortuluá spielten den Teilnehmer an den Relegationsspielen gegen den Zweitletzten der ersten Liga aus.
