Boniches liegt auf der Westseite des Iberischen Gebirges in einer Höhe von ca. 1025 m. Die Provinzhauptstadt Cuenca befindet sich gut 55 Kilometer (Fahrtstrecke) westnordwestlich. Das Klima im Winter ist gemäßigt, im Sommer dagegen warm bis heiß. Regen (ca. 514 mm/Jahr) fällt das ganze Jahr über.[2]
