Das Refuge beinhaltet Küstenlandschaft, Tundra, von Gletschern gespeiste Flüsse und Berge wie den 1474 m hohen Vulkan Mount Peulik. Im Zentrum des Gebiets liegt der bis zu 180 m tiefe namensgebende See Becharof, der mit 1200 km² der zweitgrößte See Alaskas und der größte im gesamten National Wildlife Refuge System ist.
Der Becharofsee ist das weltweit zweitgrößte Laichgebiet von Rotlachs, der Nahrungsgrundlage für eine der größten Braunbärpopulationen Alaskas ist. Der der Bristol Bay zugewandte westliche Teil des Schutzgebiets, der aus Flachlandtundra besteht, ist außerdem Lebensraum für große Säugetiere wie Rentiere, Elche und Wölfe. Die Elchpopulation erreichte erst in den 1950er Jahren ein nennenswertes Ausmaß. Die Rentierherde Northern Alaska Peninsula, eine der 13 größten Herden Alaskas, überwintert in der Region des Refuges.
Am 1. Dezember 1978 wies US-Präsident Jimmy Carter das Becharof-Gebiet zusammen mit 16 anderen Schutzgebieten Alaskas auf Basis des Antiquities Acts von 1906 als National Monument aus. Im Zuge des Alaska National Interest Lands Conservation Acts vom 2. Dezember 1980 wurde nach politischer Kritik der Status auf den eines Wildlife Refuge heruntergestuft.