Der Mengeder Bahnhof besteht aus einem Bereich für den Personennahverkehr und einem weiteren nordwestlich gelegenen Bereich für den Rangier- und Güterverkehr.
Im Personennahverkehr stehen vier Gleise zur Verfügung. Die Gleise 1 und 2 (Bahnsteiglänge 220 Meter, Höhe 76 Zentimeter) an der Strecke nach Dortmund Hbf werden von der Regional-Expresslinie RE3 („Rhein-Emscher-Express“) und seit Dezember 2019 auch der RB 32 bedient, die Gleise 4 und 5 (Bahnsteiglänge 120 Meter, Höhe 96 Zentimeter) an der Strecke nach Dortmund-Dorstfeld befährt die S-Bahn-Linie 2. Die Bahnsteige sind durch einen Fußgängertunnel miteinander verbunden. Der Gehwegtunnel ist noch nicht mit Fahrstühlen versehen, so dass der Zugang nicht barrierefrei ist. Allerdings verfügt der Bahnhof über Rampen zu den Bahnsteigen und den Ausgängen.
Am Bahnhof gibt es 136 Park-and-Ride-Stellplätze für PKWs sowie 16 Fahrradboxen im Bike-and-Ride-Konzept. Eine Erweiterung der Kapazität dieser Stellplätze ist geplant. Es besteht Umsteigemöglichkeit zu den Buslinien 289, SB24 und NE14 der Vestischen und den Linien 470, 472E, 473, 474, 475, 476 und 482 der DSW21. Die Bahnsteigüberdachung an Gleis 1 und 2 ist als Baudenkmal in die Denkmalliste der Stadt Dortmund eingetragen.[1]
Der VRR sowie die Deutsche Bahn führten 2019 die Verlängerung der Bahnsteiggleise 1 und 2 (Regionalverkehr) von 160 auf 220 Meter (RRX-Standard) und die Erneuerung der vorhandenen Abschnitte und des Wartehäuschens aus. Dieser Umbau geschah im Rahmen des RRX-Projektes. Um eine Barrierefreiheit herzustellen, wurde der Bahnsteig nach Osten (Ausgang) verlängert, die Rampe fiel dadurch weg und wurde durch einen Aufzug sowie eine Treppenanlage ersetzt. Das unter Denkmalschutz stehende Bahnsteigdach wird in Zukunft den neu geschaffenen Teil des Bahnsteigs überdachen. Vorher bestanden Überlegungen, den Bahnsteig noch länger werden zu lassen, um die Kapazität in Stoßzeiten zu erweitern, was jedoch in den Plänen bezüglich des RRX nicht berücksichtigt wurde.
Zum Fahrplanwechsel im Dezember 2019 wurde der S2-Linienast nach Duisburg durch die RB32 ersetzt.
Buslinien
Zum Fahrplanwechsel am 18. August 2021 wurde die neue Buslinie 415 eingeführt und damit die Buslinie 473 größtenteils ersetzt. Die Buslinie 473 fährt nicht mehr in Mengede, sondern nur noch zwischen Dortmund-Schwieringhausen und Dortmund-Brechten.
Der S-Bahnsteig muss wegen des Einsatzes von Fahrzeugen des Typs Stadler Flirt 3 XL seit dem 15. Dezember 2019 auf 76 cm (bisher 96 cm) abgesenkt werden. Dies wird jedoch erst längerfristig vorgenommen werden können, nämlich im Rahmen einer Modernisierungsoffensive der DB. Vor dem Umbau der Bahnhofs-Nordseite war auch der Bau eines dritten Bahnsteiges im Süden des Gleisfelds im Gespräch. Dieser wäre für die Verstärkerfahrten der S2 (bis 2015 als S24 geplant[2]) sinnvoll gewesen, da diese im Bahnhof Mengede enden. Des Weiteren wird der Einbau von Aufzügen erwogen. Diese sind jedoch nicht zwingend für einen barrierefreien Zugang notwendig, da die Zugänge bereits über Rampen verfügen.
↑Denkmalliste der Stadt Dortmund. (PDF; 180 kB) In: dortmund.de – Das Dortmunder Stadtportal. Denkmalbehörde der Stadt Dortmund, 14. April 2014, archiviert vom Original (nicht mehr online verfügbar) am 15. September 2014; abgerufen am 16. Juni 2014.Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.dortmund.de