Proteinstruktur der ACP-Domäne der Typ-II Polyketidsynthase
Acyl-Carrier-Proteine (ACP) sind eine Gruppe von Proteinen , die Bestandteil der Fettsäure-Synthase und der Polyketid -Synthase sind. Es ist außerdem eines der am meisten vorkommenden Proteine in E. coli .[ 1] In beiden Fällen ist die wachsende Kette über Thioester der Thiolgruppe des 4′-Phosphopantethein -Restes[ 2] an das ACP gebunden.
Struktur
ACPs sind eine homogene Gruppe von kleinen negativ geladenen Proteinen, die aus α-Helix-Bündeln bestehen sowie hohe Ähnlichkeit in Struktur und Aminosäuresequenz aufweisen. Die Strukturaufklärung fand via verschiedener Kernspinresonanzspektroskopie - und Kristallographie -Verfahren statt. Strukturell und mechanistisch ähneln sie den Peptidyl-Carrier-Proteinen (PCP) von nichtribosomalen Peptid -Synthasen.[ 3] [ 4] [ 5] [ 6]
Biosynthese
Nach der Expression des inaktiven apo ACPs wird der 4'-Phosphopantethein-Rest an einen Serinrest geknüpft. Diese Verknüpfung wird von der Acyl-Carrier-Protein-Synthase (ACPS), einer 4'-Phosphopantetheinyl-Transferase, katalysiert. 4'-Phosphopantethein ist eine prosthetische Gruppe von mehreren ACPs inklusive des ACPs der Fettsäure-Synthase , der Polyketid-Synthase, des Peptidyl-Carrier-Proteins und der Aryl-Carrier-Proteine der nichtribosomalen Peptid-Synthasen (NRPS).
Weblinks
Einzelnachweise
↑ John E. Cronan: The Chain-Flipping Mechanism of ACP (Acyl Carrier Protein)-Dependent enzymes Appears Universal . In: Biochemical Journal . 460. Jahrgang, Nr. 2 , 2014, S. 157–163 , doi :10.1042/BJ20140239 , PMID 24825445 (englisch).
↑ Externe Identifikatoren von bzw. Datenbank-Links zu 4′-Phosphopantethein : CAS-Nr. : 2226-71-3 , PubChem : 115254 , ChemSpider : 103123 , DrugBank : DBDB03912 , Wikidata : Q6590391 .
↑ Roujeinikova A, Baldock C, Simon WJ, Gilroy J, Baker PJ, Stuitje AR, Rice DW, Slabas AR, Rafferty JB: X-ray crystallographic studies on butyryl-ACP reveal flexibility of the structure around a putative acyl chain binding site . In: Structure . 10. Jahrgang, Nr. 6 . London, England Juni 2002, S. 825–35 , doi :10.1016/s0969-2126(02)00775-x , PMID 12057197 (englisch).
↑ Crawford JM, Vagstad AL, Ehrlich KC, Udwary DW, Townsend CA: Acyl-carrier protein-phosphopantetheinyltransferase partnerships in fungal fatty acid synthases . In: ChemBioChem . 9. Jahrgang, Nr. 10 , Juli 2008, S. 1559–63 , doi :10.1002/cbic.200700659 , PMID 18551496 , PMC 3189688 (freier Volltext) – (englisch).
↑ Volkman BF, Zhang Q, Debabov DV, Rivera E, Kresheck GC, Neuhaus FC: Biosynthesis of D-alanyl-lipoteichoic acid: the tertiary structure of apo-D-alanyl carrier protein . In: Biochemistry . 40. Jahrgang, Nr. 27 , Juli 2001, S. 7964–72 , doi :10.1021/bi010355a , PMID 11434765 (englisch).
↑ Weber T, Baumgartner R, Renner C, Marahiel MA, Holak TA: Solution structure of PCP, a prototype for the peptidyl carrier domains of modular peptide synthetases . In: Structure . 8. Jahrgang, Nr. 4 , April 2000, S. 407–18 , doi :10.1016/s0969-2126(00)00120-9 , PMID 10801488 (englisch).