Étigny liegt am Fluss Yonne, der die Gemeinde im Osten begrenzt, und liegt etwa sechs Kilometer südsüdöstlich des Stadtzentrums von Sens. Umgeben wird Étigny von den Nachbargemeinden Gron im Norden und Westen, Rosoy im Norden und Osten, Véron im Osten und Südosten sowie Marsangy im Süden und Südwesten.