في 21 يوليو1996، هاجم متمردو الهوتو مخيمًا للاجئين في البلاد وقتلوا أكثر من 300 شخص.[4] في 23 يوليو، اختبأ الرئيس نتيبانتونغانيا في منزل السفير الأمريكي موريس ن. هيوز الابن.[5] تولى الجيش السلطة في 25 يوليو، في خطوة أعلنها وزير الدفاع فيرمين سينزويهيبا عبر الراديو. تم تعيين بيير بويويا رئيسًا مؤقتًا.[5] أدان الاستيلاء العسكري زعماء دوليون بمن فيهم الرئيس الأمريكيبيل كلينتون، والأمين العام للأمم المتحدةبطرس بطرس غالي، ورئيس منظمة الوحدة الأفريقيةسليم أحمد سليم.[5] كانت هذه رابع عملية استيلاء من هذا النوع على الحكومة البوروندية منذ استقلال البلاد في عام 1962، والثانية التي تؤدي إلى تولي بويويا السلطة.[5]
بعد الانقلاب
بحسب منظمة العفو الدولية، فقد قُتل أكثر من 6000 شخص في البلاد في الأسابيع التي أعقبت الانقلاب مباشرة.[6] خلف بويويا في منصب الرئيس في عام 2003 دوميتيان ندايزيي. استمرت الحرب الأهلية حتى عام 2005.