والداه سوميترو جويوهاديكوسومو اقتصادي إندونيسي ودورا ماري سيجار المعروفة بدورا سوميترو.[2] كان جده مرجونو جويوهاديكوسومو مؤسس البنك الوطني الإندونيسي والرئيس الأول للمجلس الاستشاري الأعلى للجمهورية الإندونيسية. سمّي فرابوو باسم عمّه سوبيانتو جويوهاديكوسومو الجندي الشهيد في معركة لينكونغ. له أختان وأخ واحد: بيانتينينسيه ميدراواتي ومرياني إيكواتي، وهاشيم جويوهاديكوسومو.
قضى فرابوو حياته الطفولية خارج البلد. تخرج من الابتدائية بثلاث سنين فقط من مؤسسة فكتوريا بكوالالمبور، ماليزيا. ثم المتوسطة في المدرسة العالمية بزيورخ خلال أعوام 1963-1964، ثم الثانوية في المدرسة الأمريكية بلندن خلال أعوام 1964-1967. وفي سنة 1970، دخل الأكاديمية العسكرية الإندونيسية بماجيلانج.[3]
