تم تأسيس الشركة في عام 1999 من قبل تحالف من قبل الشركة الأم في ماليزيا والمستثمر عبد الرحمن وحيد رئيس منظمة نهضه العلماء وتخلي عن حصة البالغة 40% بعد أن انتخب رئيسا لجمهورية اندونيسيا، تم تعليق أعمال الشركة في مارس 2002 وعادة الشركة للعمل في ديسمبر 2004.
الأسطول
اعتبارا من 29 مايو 2011، أسطول طيران أسيا اندونيسيا تتكون من الطائرات التالية (بمتوسط عمر 4,2):[4]