ولدت في مومباي[4] في عائلة كاثوليكية[5]، أثارت جينيليا ضجة لكونها الكاثوليكية الوحيدة في ضاحية باندرا في مومباي. لغتها الأم هي الكونكانية، وكانت والدتها «جانيت ديسوزا» عضو منتدب لشركة فارما المتعددة الجنسيات (MNC)، والتي تركت وظيفتها في عام 2004 لمساعدة ابنتها في مهنتها. والدها نيل ديسوزا، هو مسؤول رفيع المستوى مع تاتا للخدمات الاستشارية (TCS). لديها أيضا الشقيق الاصغر، نايجل دي سوزا، الذي يعمل في بورصة بومباي.
ووفقا لجينيليا، اسمها يعني «نادرة» أو «فريدة من نوعها». جينيليا درست في ثانوية الكرمل الرسولية في باندرا، وبعدها التحقت بكلية سانت أندروز في باندرا لمتابعة البكالوريوس في الدراسات الإدارية. وبعدما أكملت دراستها بعدها مباشرة بدأت مسيرتها الفنية في أول فيلم لها، توجى ميري كاسام.