Rangka baca terbuka

Ikon rintisan

Artikel bertopik umum ini adalah sebuah rintisan. Anda dapat membantu Wikipedia dengan mengembangkannya.

Jika Anda melihat halaman yang menggunakan templat {{stub}} ini, mohon gantikan dengan templat rintisan yang lebih spesifik.

Rangka baca terbuka, terkait dengan genomik, adalah bagian dari rangkaian DNA yang tidak menyertakan kodon stop (yang berfungsi sebagai sinyal stop).

Rangka baca terbuka atau open reading frame di dalam bahasa Inggris adalah bagian tanpa kodon stop dari rangka baca DNA. Di dalam proses translasi DNA, setiap tiga basa nukelotida (kodon) diterjemahkan menjadi satu asam amino. Menggunakan prinsip ini terdapat 6 rangka baca yang mungkin di dalam menerjemahkan kodon, yaitu +1, +2, +3, -1, -2, dan -3, di mana tanda + melambangkan utas sense, dan - melambangkan utas nonsense. Pada praktiknya, rangka baca terbuka cenderung merupakan rangka baca yang menghasilkan utas protein paling panjang.[1] Open Reading Frame (ORF) adalah urutan triplet nukleotida yang dibaca sebagai codon yang menentukan asam amino, satu untaian DNA memiliki tiga frame pembacaan yang memungkinkan. Panjang dari ORF dapat mengindikasikan daerah pengkodean protein kandidat dalam urutan DNA. Bentuk ORF dapat berupa DNA atau mRNA, hal ini bergantung pada kebutuhan peneliti. Suatu ORF dapat dikatakan ORF jika satu rangkaian dengan rangkaian lainnya tidak menggunakan start codon yang sama.

Referensi

  1. ^ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/ ORF Finder (Open Reading Frame Finder)