Myxococcus


Myxococcus
Badan berbuah dari M. xanthus
Klasifikasi ilmiah Sunting klasifikasi ini
Domain: Bacteria
Filum: Myxococcota
Kelas: Myxococcia
Ordo: Myxococcales
Famili: Myxococcaceae
Genus: Myxococcus
Thaxter 1892
Spesies tipe
Myxococcus fulvus
(Cohn 1875) Jahn 1911
Spesies

Lihat teks

Sinonim
  • Myxococcus section "Simplices" Jahn 1911
  • Myxococcus section "Stipitatae" Jahn 1911

Myxococcus adalah sebuah genus bakteri pada familia Myxococcaceae. Myxococcus merupakan sebuah bakteri kemoorganotrof pembentuk spora yang merupakan sebuah aerob obligat. Mereka berbentuk batang memanjang dengan ujung yang membulat atau meruncing, serta tidak memiliki flagela. Selnya bergerak dengan melayang dan dapat mendahului bakteri lainnya. Genus ini sudah diisolasi dari tanah.

Setidaknya sebelas spesies sudah diidentifikasikan dengan pasti pada akhir 2020, dan masing-masing sudah dicirikan sampai titik tertentu. Selain menggunakan tes biokimia tradisional, genom dari beberapa spesies sudah dibandingkan menggunakan pengurutan genom. Pendekatan ini memberi bukti bahwa genus ini, seperti genera bakteri lainnya, memiliki urutan gen inti yang ditemukan pada semua anggota dari genus ini, beserta dengan beberapa yang terbatas ke satu spesies. Sehingga, identitas dari Myxococcus terus berubah. Sebuah contoh saat suatu taksonomi dapat berubah adalah perbandingan dari pengurutan genom dan tes biokimia menunjukkan bahwa M. xanthus dan M. virecens tidak dapat dibedakan.[1]

Filogeni

LTP_08_2023,[2][3][4] bedasarkan 16S rRNA GTDB 08-RS214,[5][6][7] bedasarkan 120 protein penanda
Myxococcus

M. fulvus (Cohn 1875) Jahn 1911

M. dinghuensis Wang et al. 2023

M. stipitatus Thaxter 1897

Pyxidicoccus xibeiensis Wang et al. 2023

Pyxidicoccus fallax corrig. Reichenbach 2007

Pyxidicoccus trucidator Chambers et al. 2020

M. guangdongensis Wang et al. 2023

M. qinghaiensis Wang et al. 2023

M. eversor Chambers et al. 2021[8]

M. llanfairpwllgwyngyllgogerychwyrndrobwllllantysiliogogogochensis
Chambers et al. 2021[8]

M. vastator Chambers et al. 2021[8]

M. macrosporus (Krzemieniewska & Krzemieniewski 1926) Zahler & McCurdy 1974

M. virescens Thaxter 1892

M. xanthus Beebe 1941

Myxococcus

M. stipitatus

M. fulvus

M. eversor

M. llanfairpwllgwyngyllgogerychwyrndrobwllllantysiliogogogochensis

Pyxidicoccus fallax

Pyxidicoccus caerfyrddinensis Chambers et al. 2020

Pyxidicoccus trucidator

"M. hansupus" Sharma et al. 2016[1]

M. macrosporus

M. vastator

M. virescens

M. xanthus

Referensi

  1. ^ a b Sharma, Gaurav; Narwani, Tarun; Subramanian, Srikrishna (2016). "Complete Genome Sequence and Comparative Genomics of a Novel Myxobacterium Myxococcus hansupus". PLOS ONE. 11 (2): e0148593. Bibcode:2016PLoSO..1148593S. doi:10.1371/journal.pone.0148593alt=Dapat diakses gratis. PMC 4765838alt=Dapat diakses gratis. PMID 26900859. 
  2. ^ "The LTP". Diakses tanggal 20 November 2023. 
  3. ^ "LTP_all tree in newick format". Diakses tanggal 20 November 2023. 
  4. ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF). Diakses tanggal 20 November 2023. 
  5. ^ "GTDB release 08-RS214". Genome Taxonomy Database. Diakses tanggal 10 May 2023. 
  6. ^ "bac120_r214.sp_label". Genome Taxonomy Database. Diakses tanggal 10 May 2023. 
  7. ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Diakses tanggal 10 May 2023. 
  8. ^ a b c Chambers, James; Sparks, Natalie; Sydney, Natashia; Livingstone, Paul G.; Cookson, Alan R.; Whitworth, David E. (2020). "Comparative genomics and pan-genomics of the Myxococcaceae, including a description of five novel species: Myxococcus eversor sp. nov., Myxococcus llanfairpwllgwyngyllgogerychwyrndrobwllllantysiliogogogochensis sp. nov., Myxococcus vastator sp. nov., Pyxidicoccus caerfyrddinensis sp. nov. and Pyxidicoccus trucidator sp. nov". Genome Biology and Evolution. evaa212 (12): 2289–2302. doi:10.1093/gbe/evaa212. PMC 7846144alt=Dapat diakses gratis. PMID 33022031 Periksa nilai |pmid= (bantuan).