Museum Pasteur disebut juga dengan Musée Pasteur adalah museum yang didedikasikan untuk peneliti Louis Pasteur. Museum ini terletak di dalam Institut Pasteur dengan alamat 25 Rue du Docteur Roux, arrondisemen XVe Paris, Prancis. Museum ini dibuka setiap hari pada musim panas, dengan biaya masuk gratis.
Museum ini didirikan pada tahun 1935 untuk memperingati Louis Pasteur (1822 - 1895), dan mengawetkan kenangan akan dirinya dalam apartemen tersebut dimana dia menghabiskan tujuh tahun terakhir hidupnya. Ruangan ini penuh dengan instrumen imiah yang berjumlah sekitar 1.000 buah, dan juga dipamerkan lokasi dia dimakamkan yaitu di kapel Neo-Byzantine.