Edisi pertama Merck Index diterbitkan pada tahun 1889 oleh perusahaan kimia asal Jerman, Emanuel Merck dan terutama digunakan sebagai katalog penjualan untuk daftar bahan kimia Merck yang terus bertambah jumlah produk yang dijual.[2] Anak perusahaan ini di Amerika didirikan dua tahun kemudian dan terus menerbitkan katalog ini. Selama Perang Dunia I, pemerintah Amerika Serikat melarang operasional Merck di negara tersebut dan menjadikannya perusahaan "Merck" Amerika terpisah yang terus menerbitkan Merck Index.
Pada tahun 2012, Merck Index dilisensikan pada Royal Society of Chemistry.[3] Versi daring Merck Index, termasuk catatan bersejarah dan pembaruan yang tidak ada dalam edisi cetak,[1] umumnya tersedia melalui perpustakaan penelitian. Versi daring ini juga mencakup lampiran dengan monograf tentang reaksi nama organik.
^"RSC acquires Merck Index". RSC.org (Siaran pers) (dalam bahasa bahasa Inggris). Diakses tanggal 7 Januari 2015.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)