Sebanyak 18 tim yang melaju dari babak kualifikasi kedua (sembilan juara grup dan sembilan peringkat kedua) akan diundi ke dalam tiga grup yang masing-masing berisi enam tim untuk memainkan pertandingan kandang-tandang sistem kompetisi penuh. Dua tim peringkat teratas setiap grup lolos langsung ke putaran final Piala Dunia FIFA 2026, sementara itu tim peringkat ketiga dan keempat dari setiap grup akan melaju ke babak keempat.
Pengundian untuk babak ketiga dilakukan pada 27 Juni 2024 di Kuala Lumpur, Malaysia.[2]
Penempatan unggulan berdasarkan Peringkat Dunia FIFA per 20 Juni 2024 (ditunjukkan dalam tanda kurung).[3]
Setiap grup terdiri dari satu tim dari masing-masing pot. Pengundian dimulai dari Pot 6 dan diakhiri dengan Pot 1, dengan setiap tim yang diundi ditempatkan pada posisi yang sesuai secara berurutan ke Grup A, lalu Grup B, dan terakhir Grup C.[4]
^ abcTim nasional Korea Utara memastikan bahwa tempat pertandingan melawan Qatar dan Iran dipindah ke Vientiane karena “masalah keamanan.”[6] Dua pertandingan kandang berikutnya melawan Iran dan Uzbekistan juga dipindah ke tempat netral.[7]
^AFC memindahkan pertandingan ini ke tempat netral karena masalah keamanan yang berkaitan dengan perseteruan Iran-Israel 2024.[8]
^ abcKarena Perang Israel-Hamas, Palestina akan memainkan pertandingan kandang mereka di tempat netral hingga pemberitahuan selanjutnya.[9]
