Usai serangkaian kekalahan, ia ditangkap oleh militer royalis, diadili lewat Inkuisisi, dilucuti dari jabatan rohaniwan, dan dieksekuso oleh otoritas sipil atas dakwaan pengkhianatan pada 1815. Morelos adalah pahlawan nasional di Meksiko dan dianggap sebagai pemimpin militer paling sukses meskipun pada kenyataannya ia tak pernah berkarir militer dan hanya menjadi imam.
Archer, Christon I. "Death's Patriots--Celebration, Denunciation, and Memories of Mexico's Independence Heroes: Miguel de Hidalgo, José María Morelos, and Agustín de Iturbide" in Death, Dismemberment, and Memory in Latin America, Lyman L. Johnson, ed. Albuquerque: University of New Mexico Press 2004 pp. 63–104.
Guedea, Virginia. "José María Morelos" in Encyclopedia of Mexico, Chicago: Fitzroy Dearborn, 1997, pp. 948–950.
Hamnett, Brian R. Roots of Insurgency: Mexican Regions, 1750-1824. Cambridge: Cambridge University Press 1986.
Lemoine Villacaña, Ernesto. Morelos, su vida revolucionaria a través de sus escritos y de otros testimonios de la época. Mexico City: Universidad Nacional Autónoma de México 1965.
Timmons, Wilbert H. Morelos: Priest, Soldier, Statesman of Mexico, revised edition. El Paso: Texas Western College Press 1970.