Istilah dalam arti yang lebih luas mengacu pada bagian Pegunungan Alpen Timur yang terletak di wilayah negara bagian Bayern. Namun secara tradisional dipahami bahwa Pegunungan Alpen Bayern hanyalah rentang antara sungai Lech dan Saalach (Altbayern). Dalam arti yang sempit, Alpen Allgäu di Schwaben, yang baru-baru ini menjadi bagian dari Bayern, dan Alpen Berchtesgaden di sebelah timur tidak dianggap sebagai bagian dari Pegunungan Alpen Bayern.
Istilah ini sering digunakan, tetapi tidak sesuai dengan klasifikasi umum Pegunungan Alpen Timur (AVE) yang dikembangkan oleh klub Alpen Jerman, Austria, dan Tirol Selatan. Istilah ini juga tidak dapat disamakan dengan istilah Pra-Alpen Bayern. Yang terakhir hanya mencakup bagian pegunungan Pra-Alpen Bayern antara Sungai Loisach di barat dan Sungai Inn di timur.
Pegunungan Alpen Bayern dalam arti yang lebih luas mencakup bagian pegunungan yang terdaftar berikut - dalam gambaran umum tabel ini diurutkan menurut klasifikasi AVE secara kasar dari barat ke timur dan dengan ketinggian maksimum di atas permukaan laut (NN). Puncak dan ketinggian tertinggi yang ditampilkan berhubungan dengan bagian dari kelompok pegunungan yang terletak di Bavaria, dan tidak dengan kelompok keseluruhan. Misalnya, puncak tertinggi di Alpen Allgäu, Großer Krottenkopf yang setinggi 2.657 m di atas permukaan laut (AA), terletak di Tirol tidak ditampilkan dalam tabel.
