Lahan di mana Lippo Plaza Baubau berdiri dahulu ditempati oleh kantor Bupati Buton saat Baubau masih berstatus sebagai kecamatan di Kabupaten Buton (kantor tersebut saat ini berlokasi di Dongkala).[2][3] Mal ini dibuka untuk pertama kali pada tanggal 22 Desember 2014, ketika penyewa kunci pertama, Hypermart, dibuka. Tamu undangan acara peresmian toko swalayan tersebut mencakup Wali Kota BaubauAbdul Sajid Tamrin dan Bupati BombanaTafdil.[4] Nama mal sebelumnya adalah Lippo Plaza Buton, sebelum diganti menjadi Lippo Plaza Baubau pada tanggal 22 September 2023 untuk menegaskan lokasinya di Kota Baubau.[5]
Gedung Lippo Plaza Baubau terdiri atas 1 lantai saja. Selain Hypermart, penyewa kunci lain mal adalah Matahari Department Store yang dibuka pada tanggal 9 April 2015.[6] Pada tanggal 15 Januari 2016, jaringan bioskop nasional Cinépolis (Cinemaxx sebelum tahun 2019) membuka cabang di Lippo Plaza Baubau, dengan 4 teater yang menyediakan kapasitas 610 kursi.[7] Pada tanggal 7 Agustus 2021, MR.DIY membuka gerai pertama mereka di Baubau di mal ini.[8]
