Лодка совершила 15 боевых походов. Потопила 5 судов суммарным водоизмещением 17146 брт, повредила одно судно водоизмещением 4043 брт. Ещё одно судно водоизмещением 5062 брт после повреждений не восстанавливалось.
U-561 была потоплена 12 июля1943 года в Мессинском проливе, в районе с координатами 38°16′ с. ш. 15°39′ в. д.HGЯO, торпедами британского торпедного катера HMS MTB-81. 42 человек погибли, 5 членов экипажа спаслись.
Атаки на лодку
15 июля1942 года находящаяся к востоку-северо-востоку от Порт Саида лодка обстреляла из своих 20-мм зениток приближающийся «Либерейтор», ошибочно опознанный как «Сандерленд». Немцы наблюдали попадания в самолёт, пролетевший над лодкой без сброса бомб. U-561 экстренно погрузилась, но после всплытия через час была атакована повторно. Снова обстрелявшие самолёт из зениток подводники на этот раз заметили, что он загорелся, экстренно сбросил бомбы и рухнул в море. Все семеро лётчиков погибли.
Helgason, Guðmundur.U-561(англ.). uboat.net (1995-2009). Дата обращения: 9 августа 2020.
Литература
Бишоп К. Подводные лодки кригсмарине. 1939—1945. Справочник-определитель флотилий = Kriegsmarine U-boats 1939—1945. — М.: Эксмо, 2007. — 192 с. — (Военная техника III Рейха). — ISBN 978-5-699-22106-6.
Роувер Ю. Субмарины, несущие смерть. Победы подводных лодок стран гитлеровской Оси = Jürgen Rohwer. Axis submarine successes 1939—1945. — М.: ЗАО Изд-во Центрполиграф, 2004. — 416 с. — 2000 экз. — ISBN 5-9524-1237-8.
Герберт Вернер Стальные гробы. Немецкие подводные лодки: секретные операции 1941—1945 — М.: ЗАО Изд-во Центрполиграф, 2001. — С. 105—106. — 474 с. — ISBN 5-227-01245-8