ADN Z

Structure de l'ADN Z.

L'ADN Z est une forme d'ADN caractérisée par une double hélice gauche, contrairement à l'ADN B, naturellement la plus courante, et à l'ADN A, observée notamment après déshydratation de la première. L'ADN Z est plus étroit que l'ADN B et l'ADN A, avec un allongement supérieur par paire de bases ajoutée. Cette forme d'ADN bicaténaire jouerait un rôle dans le relâchement des tensions induites par le surenroulement de l'ADN lors de la réplication[1],[2]. L'apparition d'ADN Z coïncide par ailleurs avec les régions du génome à forte activité de transcription.

De gauche à droite : ADN A, ADN B et ADN Z.
Paramètres structurels indicatifs des trois principales formes d'ADN bicaténaire[3],[4],[5]
Paramètre ADN A ADN B ADN Z
Sens de l'hélice droite droite gauche
Motif répété 1 bp 1 bp 2 bp
Angle de rotation par paire de bases 32,7° 34,3° 60°/2
Nombre de paires de bases par tour d'hélice 11 10,5 12
Pas de l'hélice par tour 2,82 nm 3,32 nm 4,56 nm
Allongement de l'axe par paire de bases 0,24 nm 0,32 nm 0,38 nm
Diamètre 2,3 nm 2,0 nm 1,8 nm
Inclinaison des paires de bases sur l'axe de l'hélice +19° −1,2° −9°
Torsion moyenne (propeller twist) +18° +16° 0°
Orientation des substituants des bases
sur les résidus osidiques		 anti anti Pyrimidine : anti,
Purine : syn
Plissement / torsion endocyclique du furanose
(Sugar pucker)		 C3’-endo C2’-endo Cytosine : C2’-endo,
Guanine : C3’-endo

Notes et références

  1. ↑ (en) Sung Chul Ha, Ky Lowenhaupt, Alexander Rich, Yang-Gyun Kim et Kyeong Kyu Kim, « Crystal structure of a junction between B-DNA and Z-DNA reveals two extruded bases », Nature, vol. 437, no 7062,‎ , p. 1183-1186 (PMID 16237447, DOI 10.1038/nature04088, Bibcode 2005Natur.437.1183H, lire en ligne)
  2. ↑ (en) Alexander Rich et Shuguang Zhang, « Z-DNA: the long road to biological function », Nature Reviews Genetics, vol. 4, no 7,‎ , p. 566-572 (PMID 12838348, DOI 10.1038/nrg1115, lire en ligne)
  3. ↑ (en) Richard R Sinden, DNA structure and function, Academic Press, , 398 p. (ISBN 0-12-645750-6)
  4. ↑ (en) Rich A, Norheim A, Wang AHJ, « The chemistry and biology of left-handed Z-DNA », Annual Review of Biochemistry, vol. 53,‎ , p. 791–846 (PMID 6383204, DOI 10.1146/annurev.bi.53.070184.004043)
  5. ↑ (en) Ho PS, « The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA », Proc Natl Acad Sci USA, vol. 91, no 20,‎ , p. 9549–9553 (PMID 7937803, PMCID 44850, DOI 10.1073/pnas.91.20.9549, Bibcode 1994PNAS...91.9549H)