1990 wurde die S-Bahn-Station errichtet. Sie liegt etwa 250 Meter südlich des ehemaligen Standorts des historischen Lokalbahnhofes und der heutigen Straßenbahn-Station. Bedient wird sie von den S-Bahn-Linien, die aus der Innenstadt kommend Richtung Südbahnhof führen (S3–S6).
Ein Kuriosum ist, dass in diesem nach dem einstigen Bahnhof der nach Offenbach am Main führenden Lokalbahn benannten S-Bahnhof alle S-Bahn-Linien des Citytunnels halten, mit Ausnahme derer, die nach/über Offenbach fahren.
2016 erhielten die Hintergleiswände des Bahnhofs einen neuen, farbigeren Anstrich. Zudem wurden die taktilen Leitstreifen im Bahnsteig erneuert.