Pulau Wetar terdiri dari 4 kecamatan yakni; Kecamatan Wetar, Kecamatan Wetar Barat, Kecamatan Wetar Timur dan Wetar Utara. Terdiri dari 23 desa (Karbubu, Tolemar, Arnau, Hiai, Ilwaki, Ilputih, Mahuan, Masapun, Tomliapat, Ilpokil, Kahiling, Ilway, Arwala, Moning, Uhak, Lurang, Naumatang, Esulit, Nabar, Eray, Ilmamau, Klisatu, Ustutun). Dengan ibu kota kecamatan di Desa Ilwaki. Sejak berdirinya Kecamatan Wetar, telah dipimpin oleh 3 orang camat.
Daftar pulau
Pulau-pulau yang merupakan bagian dari Kecamatan Wetar adalah:
Untuk menuju ke Pulau Wetar, akses yang dapat digunakan adalah kapal motor, dengan rute Ambon - Kupang Pulang-pergi dan hanya dilayani oleh 2 kapal motor yaitu KM. Pangrango dan KM. Maloli.
KM. Pangrango berkapasitas penumpang sekitar 500 orang, dengan jadwal pelayaran yang lebih pasti daripada KM. Maloli, yaitu 2 minggu sekali. Sementara, KM. Maloli berkapasitas sedikit di bawah KM. Pangrango. Waktu tempuh Ilwaki - Kupang, kurang lebih 24 jam, dengan kecepatan kapal maksimal 20 km/jam (untuk KM. Pangrango).
Ekonomi
Kecamatan Wetar merupakan penghasil kopra, masih banyak potensi alam yang besar tetapi belum digali dengan baik, seperti kacang mede, asam jawa, pala hutan, hasil laut dan madu hutan.
Infrastruktur
Infrastruktur di Wetar sementara masih sangat minim. Jaringan jalan hanya ada di Ilwaki dan untuk menjangkau desa yang lain masih harus menggunakan kapal layar bermotor.
Telekomunikasi
Sarana telekomunikasi hanya mengandalkan SSB dan GSM. SSB mampu menjangkau seluruh desa di Wetar, tetapi untuk GSM hanya di Ilwaki (ibu kota kecamatan), itu pun dengan radius kurang lebih 100 meter.