SMA Negeri 3 Bekasi mulai dirintis sejak tahun 1986 bertempat di SMAN 2 Bekasi. Pada saat itu SMA Negeri 3 Bekasi dipimpin oleh Ibu Siti Bulan Rasyid yang juga menjabat sebagai kepala sekolah SMAN 2 Bekasi.
Baru pada tahun 1988 SMA Negeri 3 Bekasi mempunyai kepala sekolah secara difinitif yaitu Bapak Drs. Sahidin Azhari. Februari 1990 SMA Negeri 3 Bekasi pindah ke Pekayon karena sudah mempunyai gedung sendiri. Bangunan berasal dari Pemerintahan Pusat yang terdiri dari 3 unit masing-masing 2 lantai. Pada saat pindah ke Pekayon SMA Negeri 3 mempunyai jumlah siswa 6 kelas yaitu:
Kelas 1 dua rombongan
Kelas 2 dua rombongan
Kelas 3 dua rombongan.
Karena banyak peminat ingin masuk ke SMA Negeri 3 Bekasi, maka pada tahun 1996 membuka kelas baru (filial) dan menerima 5 kelas untuk kelas satu. SMA Filial berada di Jl. Pengairan RT. 01/01 Pekayon. Sekarang ini pengelolaan siswa dan keuangan sudah terpisah antara induk dan filial, karena SMA Filial tersebut sudah menjadi SMA Negeri 8 Bekasi.
Seiring berkembangnya, dan bertambahnya peminat yang ingin bersekolah di SMA Negeri 3 Bekasi, untuk kedua kalinya dibukalah kelas baru (filial) pada tahun 2008 yang pada tahun 2012 sudah berdiri sendiri di Jl. H. Ilyas, Cikunir, Jakamulya. Sekarang ini pengelolaan siswa dan keuangan sudah terpisah antara induk dan filial, karena SMA Filial tersebut sudah menjadi SMA Negeri 17 Bekasi.
Ekstrakurikuler
Kegiatan Ekstrakurikuler SMA Negeri 3 Bekasi
Kegiatan ekstrakurikuler merupakan kegiatan rutin sekolah dalam setiap tahun pelajaran. Kegiatan ekstra kurikuler ini terlahir sebagai respon terhadap perkembangan dan perubahan dalam kehidupan bermasyarakat, berbangsa, dan bernegara. Kegiatan ini memberikan dasar – dasar pengetahuan, ketrampilan, keahlian, serta pengalaman belajar yang akan membangun integritas sosial serta mewujudkan karakter pembelajaran yang sejalan dengan prinsip belajar seumur hidup dan pengalaman belajar sepanjang hayat (learning to life) yang mengacu pada empat pilar pendidikan universal, yaitu belajar mengetahui (learning to know), belajar melakukan (learning to do), belajar menjadi diri sendiri (learning to be), dan belajar hidup dalam kebersamaan (learning to live together).
Kegiatan ekstrakurikuler akan sangat membantu siswa dalam menampung, menyalurkan, membimbing bakat dan minatnya. Selain itu, dengan adanya kegiatan ekstra kurikuler, hal ini akan meningkatkan skill / keahlian siswa dalam menghadapi persaingan hidup di era globalisasi ini. Selain itu, kegiatan ini akan meningkatkan prestasi sekolah baik akademik maupun non akademik.
Adapun kegiatan ekstrakurikuler yang ada di SMA Negeri 3 Bekasi adalah sebagai berikut:
Mading (GALAKSI)
Rohis IRMA (Ikatan Remaja Masjid Al-Jihad)
RohKris (Voelzhier Christian Community)
Pencak Silat
Shorinji Kempo
Taekwondo
English Club
Korean Club
French Club
Japanese Club
KIR
Tari Saman (SAGAZEALOUS)
Himpunan Penempuh Rimba & Pendaki Gunung (PALAGASI)
