Pada tahun pertama SMAK 5 Penabur membuka 5 kelas untuk siswa kelas 1 dan dengan sarana/prasarana yang masih terbatas. Sebagian besar guru berasal dari SMAK 3 Penabur. Pada angkatan pertama siswa SMAK 5 Penabur mengikuti Ujian Nasional (dahulu bernama EBTANAS), siswa Jurusan MIPA SMAK 5 Penabur meraih prestasi peringkat ke-3 DKI Jakarta. Sejak itu nama SMAK 5 Penabur dikenal oleh masyarakat dan dinilai sebagai salah satu sekolah swasta terbaik di DKI Jakarta, dimana siswa-siswi SMAK 5 Penabur baik dari Jurusan IPA maupun dari Jurusan IPS selalu meraih prestasi tinggi, baik dalam Ujian Nasional maupun dalam berbagai perlombaan baik di tingkat nasional maupun internasional. Melalui prestasi dan kualitas pendidikan di SMAK 5 Penabur, nama SMAK 5 Penabur dikenal sebagai salah satu sekolah unggulan di daerah Jakarta Utara serta sekolah yang berakreditasi A.
Gedung sekolah
Gedung SMAK 5 Penabur merupakan salah satu gedung di dalam lingkungan kompleks Sekolah Penabur Kelapa Gading, selain TKK 6 Penabur, SDK 6 Penabur, dan SMPK 4 Penabur.
Gedung SMAK 5 Penabur memiliki luas 2.048 m2 dan terdiri dari empat lantai. Lokasi sekolah dapat dikatakan cukup strategis, karena dekat dengan lingkungan perumahan dan mudah untuk diakses dari berbagai tempat, baik dengan kendaraan pribadi maupun dengan kendaraan umum. Sekolah yang berada di bawah naungan Yayasan Pendidikan BPK Penabur Jakarta ini juga didukung oleh Gereja Kristen Indonesia, khususnya GKI Gading Indah, GKI Sunter, GKI Kayu Putih, dan GKI Melur.
Kurikulum
Kurikulum SMAK 5 Penabur adalah kurikulum nasional yang dirancang secara kreatif & inovatif untuk menggali serta mengembangkan potensi peserta didik. Di samping program pembelajaran di dalam kelas (intrakurikuler), siswa juga dapat mengikuti kegiatan ekstrakurikuler sebagai wadah penyaluran dan pengembangan minat serta bakat para siswa.
Program pembelajaran di SMAK 5 Penabur Jakarta juga didukung oleh tenaga pengajar profesional yang berkualitas baik dan kompeten dalam bidangnya di samping tersedianya guru kepemimpinan/leadership, guru bahasa asing (Jerman, Prancis, dan Mandarin), guru bimbingan konseling, guru seni, dan native speaker, serta ditunjang oleh sarana/prasarana pendidikan yang berkualitas.
Dalam rangka memenuhi kebutuhan sumber daya manusia yang berkualitas dalam ilmu pengetahuan, memiliki iman yang teguh, serta mempunyai jiwa kepemimpinan, SMAK 5 Penabur Jakarta berupaya untuk mendidik para siswanya agar memiliki ilmu pengetahuan yang tinggi dengan berlandaskan iman Kristiani, membentuk karakter pribadi yang mandiri, bertanggung jawab, berwatak mengasihi serta mampu menjadi pemimpin.
Pimpinan
SMAK 5 Penabur mengalami sembilan kali pergantian pimpinan, yaitu;
Ruang belajar ber-AC, White board, LCD Projector, CCTV Komputer dan white board;
Laboratorium Komputer (40 unit untuk siswa dan 2 unit untuk guru);
Laboratorium Bahasa (40 unit dan komputer dan 2 unit TV);
Laboratorium Akuntansi (40 unit untuk siswa dan 2 unit untuk guru);
Laboratorium Kimia, Fisika & Biologi dengan para teknisi laboratorium;
Ruang OSIS;
Ruang UKS (Unit Kesehatan Sekolah);
Ruang Bimbingan Konseling dan ruang konseling pribadi;
Ruang Radio Siswa;
Ruang Koperasi Siswa;
Perpustakaan SMAK 5, memiliki sekitar 10.000 koleksi (buku bacaan, buku pelajaran, buku penunjang), koleksi Video, CD, VCD, DVD, kaset, dilengkapi dengan LCD, layar projektor, TV, komputer berikut jaringan internet;
Ruang pembelajaran musik;
Ruang Rapat ber-AC;
Ruang serbaguna (Aula) sebagai gereja dan tempat kegiatan (kapasitas mencapai 900 orang dengan fasilitas yang memadai);
Ruang guru yang dilengkapi dengan komputer (jaringan internet) untuk setiap bidang studi;
Lapangan olahraga: basket, bola voli (bersama dengan lapangan basket), futsal, dan sebagainya;
"Panggung Apresiasi" sebagai tempat pertunjukan kreativitas dalam berbagai kegiatan sekolah;
Kantin dan koridor kelas yang bersih dan asri;
Taman sekolah beserta apotek hidup; dan
Papan mading di setiap lantai untuk mewadahi karya siswa/guru.
