Hubungan Afrika Selatan dengan Mesir adalah hubungan antara pemerintahan Republik Arab Mesir dan Republik Afrika Selatan. Misi Afrika Selatan pertama di Mesir didirikan pada 1942 sebagai konsulat-jenderal. Mesir menjalin hubungan diplomatik dengan Afrika Selatan sampai 1961.[1]
Mesir memberlakukan seluruh sanksi internasional terhadap pemerintahan Afrika Selatan. Setelah 1979, hubungan tak resmi dan ketegangan militer merenggang. Duta besar hanya ditukar pada 1990. Mesir memiliki kedubes di Pretoria dan Afsel memiliki kedubes di Kairo. Kedua negara merupakan anggota penuh Uni Afrika, G-24, G-77 dan Gerakan Non-Blok.